拍擊式無菌均質器的工作原理：

    將原始樣本（大的需要剪成約10×10mm塊狀），與某種液體或溶劑放入均質袋，經本儀器的錘擊板反復在樣品均質袋上錘擊，產生壓力、引起振蕩、加速混合、從而達到溶液中微生物成分處于均勻分布狀態(tài)。

    均質器門底部為防止均質袋意外破裂，便于清洗溢出物，底部設計為空的，可放置接水盤，所以儀器運轉時請勿用手從底部伸入，以免紋傷手指。均質器工作時好不要打開均質器門，造成不必要的損失。  儀器和均質袋的存放都應避免陽光的直接照射，特別是均質袋應存放在無陽光或避免紫外線照射的地方，以免老化。